张发荣教授学术精深，自成一格，在学术思想上，他力倡“寒温结合”，认为伤寒和温病是继承和发展的关系，提出了寒温统一外感热病辨证论治纲领；创立了糖尿病 “阴虚燥热、燥热伤津、阴损及阳、阴阳俱损，热瘀互结贯穿始终”的病机学说，“治消渴，补脾肾；益气阴，清虚热，通瘀络、虚瘀并治”的糖尿病并发症治疗原则；提出“中风从痰、瘀论治”观点，认为痰瘀阻塞脑窍是急性中风的关键病机等。张发荣教授主持、主研部省级以上课题17项，获得部省级科技进步奖15项，其中一等奖4项，二等奖5项，三等奖6项，独著、主编、合编《中医内科学》、《中西医结合糖尿病治疗学》、《中西医结合脑髓病学》、《实用中医内科学》等学术专著14部。